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适用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex

 更新时间:2020-06-05 点击量:857

paragongenomics适用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex®

 

该基于扩增子的SARS-CoV-2 NGS面板专为COVID19冠状病毒研究和监测而设计,可对负责COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒进行完整的基因组测序。该面板专门针对MGI Tech的DNBSEQ平台。其他版本可用于  Illumina测序平台。 

SKU:paragongenomics 918001

类别:CleanPlex对于MGI,CleanPlex为MGI现成的使用面板,传染病,产品,准备到使用NGS面板标签:靶富集,靶向测序,扩增子测序,多重PCR,下一代测序,定向重测序,NGS面板,NGS测定,PCR扩增子测序,SARS-CoV的-2 ,研究面板,COVID19,2019-nCoV,传染性疾病监测

产品描述

用于MGI SARS-CoV-2的CleanPlex®面板,用于通过MGI Tech的DNBSEQ平台上的下一代测序(NGS)的基于扩增子的靶标富集检测,跟踪和研究COVID19冠状病毒

Paragon Genomics设计了一个高度多重的靶标富集板,覆盖了SARS-CoV-2病毒的整个基因组(末端的92个碱基除外)。该小组能够对负责COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒进行完整的基因组测序和流行病学研究。借助Paragon Genomics CleanPlex技术,可在5小时内将病毒的整个基因组从RNA扩增到序列就绪的文库。该面板的两个版本可用于两个主要的测序平台:Illumina和MGI。CleanPlex技术可轻松,灵活地对样品进行测序,以确保对传染病的监测和研究。

 

强调

  • 节省大量成本
    降低测序成本98%。许多散弹枪宏基因组测序方法所需的每个样品仅需要0.2M读数,而  1000万个读数。
  • 目标区域的高覆盖率
    整个SARS-CoV-2基因组的覆盖率达到99%
  • 灵敏检测
    可以高置信度检测多达1个拷贝,而RT-qPCR可以检测3-5个拷贝(1)
  • 快速,简化的工作流程
    使用快速的四步协议(包括RT步骤)以少的动手时间,只需5.5小时即可生成可测序的文库。
  • 性能超群
    准备高质量的NGS库具有优良的对目标使用CleanPlex技术,使高效利用测序读取性能。CleanPlex专家组的准靶率通常比混合捕获的小靶标富集专家组的靶率高得多。

 

CleanPlex SARS-CoV-2面板包含带有RT组件的CleanPlex多重PCR引物和CleanPlex靶向库试剂盒。CleanPlex索引PCR引物和CleanMag ®  磁珠单独订购完成从输入RNA工作流测序就绪NGS库。

 

储存温度

储存在-20°C。

 

(1)Corman VM等。通过实时RT-PCR检测(2019-nCoV)https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

仅供研究使用。不用于诊断过程。

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(左)使用含有SARS-CoV-2的N和S基因的质粒,通过一个单一的工作流程进行检测,显示了低拷贝数下的检测率。结果表明,检出率为1.1份时为56%,当存在2份以上时为100%。通过使用两个池来覆盖整个病毒基因组,预期灵敏度只会进一步提高。(右)对于检测到的这些,该小组能够平均捕获10倍读取深度范围内的所有靶标,以获得2.8个病毒拷贝,类似地,除了一个靶标外,所有靶标均捕获1.4个病毒拷贝。所有目标也均匀分布在整个GC范围内。

 

附加信息

包装尺寸(反应)

8、96、384